Wkraczając do wnętrza kościoła, natychmiast przenosimy się z palącego andaluzyjskiego słońca w ciche i uroczyste miejsce. Patrząc w górę, widzimy strzeliste gotyckie sklepienia, które rozciągają się jak gigantyczne drzewa wyrzeźbione z kamienia. Światło słoneczne wpada przez witraże, rzucając barwne smugi na cętkowaną kamienną posadzkę. W najgłębszej części nawy głównej znajduje się zapierający dech w piersiach ołtarz główny (Retablo Mayor). Niezliczone pozłacane posągi gęsto opowiadają historie biblijne, lśniące w słabym świetle świec, emanując spokojną, ale wstrząsającą siłą. Najbardziej uderzającym elementem w kościele jest jednak grób Kolumba. Posągi czterech hiszpańskich królów: Kastylii, Leónu, Aragonii i Nawarry, dumnie podtrzymują trumnę tego wielkiego nawigatora. Stojąc przed grobowcem, burzliwe fale epoki morskiej potęgi kontrastują z cichą majestatycznością tej sali, skłaniając do refleksji nad zmiennością i przemijaniem czasu.